生物质能产业化程度低，导致我国生物质资源的严重浪费：
由于生产技术和利用率的普遍降低，我国在生物质能源这一块始终得不到高速发展，不过随着技术的逐渐成熟以及生物质颗粒展现出的优势点，相信在未来我国的生物质能源利用率会逐渐上升。
生物质颗粒燃料的卡路里值和灰分含量比中煤的卡路里值低约10%。但是，尽管生物质颗粒燃料在工作条件下用尽了能量，但煤无法燃烧，在燃烧的材料中留下了10%至15%的易燃成分。因此，这两个卡路里值在实际使用中是等效的。
使用生物质颗粒燃料作为锅炉燃料的成本和时间要比使用煤时少。使用生物质颗粒燃料的0.5吨锅炉可将燃煤成本降低11%，并节省34%的时间。与煤相比，0.5吨锅炉的燃料成本降低了10%，并节省了16%的时间。
一般生物质颗粒燃料的连续燃烧时间是软质散料的8-10倍，处于连续燃烧状态。
服务配套措施跟不上：
生物质能颗粒产品生产出来后，运输、贮藏、供应等服务措施跟不上，用户使用不方便。